وقتی تعداد سایتهای استفاده کننده از isolated application pool بیش از حدود ۶۰ سایت باشند.ویندوز در اختصاص منابع به انها با مشکل مواجه میشود.برای حل مشکل باید از امکان  UseSharedWPDesktop استفاده شود.
راه حل:
به کلید HKEY_LOCAL_MACHINE\System\CurrentControlSet\Services\W3SVC در رجیستری رفته و یک مقدار dword با نامUseSharedWPDesktop ایجاد کنید و مقدار را برابر با ۱ قرار دهید.
بعد از restart کردن iis مشکل برطرف خواهد شد.

منابع:
http://support.microsoft.com/kb/831135
http://blogs.msdn.com/david.wang/archive/2006/01/25/Security_considerations_of_UseSharedWPDesktop_on_IIS6.aspx